Село було розділене на дві частини: одна - колгоспна, друга - радгоспна. Школа находилась на вулиці радгоспній і була підзвітною Саратському відділу освіти. Школа знаходилася в пристосованому німецькому приміщенні. Було 2 збірних класи, в яких навчались діти різного віку. Перші випускники стали активними будівниками нового життя. Багато з них, отримавши освіту, працювали спеціалістами в колгоспі і радгоспі.

Першим директором і організатором школи був Ваврищук Матвій Дем’янович, який приїхав із Волинської області Ковельського району. Він був випускником гімназії, пройшов школу громадянської війни. Матвій Дем’янович дуже любив і цінив життя, старався зробити його кращим. Все своє життя він учився сам і вчив інших. Всі, хто з ним працював і чиї діти вчились у нього, з повагою і теплотою відгукуються про цю людину. Разом з ними працювали Чернецька Ганна Абрамівна, Кушнір Марія Олексіївна. Ганна Абрамівна Чернецька згодом стала інспектором обласного відділу освіти, а Кушнір Марія Олексіївна пропрацювала в нашій школі до глибокої старості.

Із перших випускників землякам запам’ятались такі учні: Майданюк Володимир Павлович - старший військовий льотчик. Все життя пропрацювала в селі бухгалтером Рибак Лідія Степанівна. Бондаренко Данило Сергійович - цілинник, нагороджений Орденом Трудового Красного прапору. Скорук Омелян Маркович - передовик сільського господарства, учасник обласного конкурсу молодих трактористів.

В 1951 році стала семирічною з українською мовою навчання.

В 1958 році - Вишняківська восьмирічна школа.

В 1976 році школа перейшла у нову будову. Мова навчання російська (за заявами батьків)

15 серпня 1989 року перейменована у Вишняківську неповну середню школу.

15 серпня 1993 року перейменована у Вишняківську загальноосвітню школу І-ІІ степенів.

З 01 вересня 1995 року відповідно рішення виконкому Арцизької районної ради народних депутатів № 47 від 25 травня 1995р. перейменована у Вишняківську загальноосвітню школу І-ІІІ степенів.

З 01 вересня 1997 року відповідно розпорядження Арцизької райгосадміністрації № 368 від 29 червня 1997 року перейменована у Вишняківську загальноосвітню школу І-ІІ степенів.

З 2003 року по 2011 рік - Загальноосвітня школа І-ІІ ступенів с. Вишняки.

З 04 січня 2011 року відповідно рішення Арцизької районої ради № 860-V від 22 жовтня 2011 року перейменована у Вишняківський навчально-виховний комплекс «Загальноосвітня школа І-ІІ ступенів – дошкільний навчальний заклад» Арцизької районної ради Одеської області.

Директорами школи в різні роки були: учасники Великої Вітчизняної війни Крючков В.І. і Бочкарьов М.С.; Стоянова О.М., Виноградов В.І., Чеботаєв В.С. Дерменжи Г.Д. З 2000 року школу очолює Панова Марія Михайлівна, випускниця Тираспільського педінституту, яка прийшла в нашу школу сімнадцятирічною дівчинкою в 1968 році і викладала математику 13 років, 20 років була завучем, та до цих пір є директором школи.

Серед випускників школи є вчителі, які повернулися в рідну школу і працюють уже багато років (Ралюк А.П., Ройлян А.П., Константинова Л.П., Рубан С.І.); молоді (Мартинюк К.П., Романюк О.П.), військові (Рибак В.Н., Рибак А.Н., Райлян Г.В., Станев В.С.); спеціалісти сільського господарства, лікарі та інші.

Більшість випускників школи продовжують навчання в Арцизькій СШ № 5 І-ІІІ ступенів і стають студентами різних вищих навчальних закладів.

Відповідно рішення Арцизької районної ради № 338-УІІ від 30 травня 2017 року Вишняківський навчально-виховний комплекс «Загальноосвітня школа І-ІІ ступенів – дошкільний начальний заклад Арцизької районної ради Одеської області реорганізовано шляхом приєднання до опорного закладу - Арцизького навчально-виховного комплексу «Загальноосвітня школа І -111 ступенів №1-гімназія – міжшкільний навчально-виробничий комбінат – дошкільний навчальний заклад» Арцизької районної ради Одеської області» з отриманням статусу філії «Вишняківський навчально-виховний комплекс «Загальноосвітня школа 1-11 ступенів – дошкільний навчальний заклад» Арцизького навчально-виховного комплексу «Загальноосвітня школа І -111 ступенів №1-гімназія – міжшкільний навчально-виробничий комбінат – дошкільний навчальний заклад» Арцизької районної ради Одеської області».